主要从事计算机辅助药物设计、计算生物学、药物基因组学等领域研究。先后在《PNAS》、《PLOS ONE》、《Toxicological Sciences》等国际期刊上发表发表SCI收录论文60余篇，单篇最高引用64篇次，累计引用280余篇次。申请发明专利5项，获权2项。先后指导本科生参加美国数学建模竞赛获二等奖和三等奖各一项；指导研究生获得重庆市优秀博士学位论文1人，重庆市优秀硕士学位论文1人，重庆大学优秀毕业研究生3人。现为《Journal of Medicinal Chemistry》，《Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters》，《SCIENCE IN CHINA》，《CHINESE JOURNAL OF STRUCTURAL CHEMISTRY》等杂志审稿人。
近年来，主要进行基于结构的合理药物设计、遗传异质性药物毒副作用机理与个性化医疗等相关研究。