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[00027066]基于基因组测序的体细胞突变位点挖掘方法
联系人： 华中农业大学
所在地：湖北 武汉市
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资料保密
对所交付的所有资料进行保密
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技术详细介绍
摘要：本发明公开了一种基于基因组测序的体细胞突变位点挖掘方法。本发明通过对野生型柚和突变型柚的各个组织的深度重测序，对得到的高质量的测序reads和甜橙基因组进行比对获得各组材料的单核苷酸多态性位点(SNP)。基于这些全基因组分布的SNP位点，对野生型柚和突变型柚设计case-control型的关联分析，得到突变相关的候选位点，对这些候选位点进行注释，并推测性状相关变异发生的染色体区域，最后利用Sanger测序方法对候选位点进行验证，获得了突变型柚的变异位点。该方法最大的优势在于低成本、周期短。完成一个突变体突变位点挖掘的成本在2万元左右，在3个月时间内可完成，体现了基因组前沿技术和柑橘传统育种研究的结合与创新探索。本发明还公开了所述方法的开发及应用。
