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[00044666]一种基于TM‑align的多域蛋白模板搜索方法
联系人： 浙江工业大学
所在地：浙江 杭州市
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技术详细介绍
一种基于TM‑align的多域蛋白模板搜索方法，首先，从蛋白质库中提取多域蛋白建立多域蛋白质库；然后，基于蛋白质结构比对工具TM‑align计算模板蛋白对于每个单域蛋白的局部比对得分，并取最高值为模板的局部得分；其次，选出局部得分最高的前500个模板进行全局评价，按照单域蛋白的比对顺序分多种情况进行评价，在评价过程中，模板中的各残基禁止重复比对，并且遵循查询蛋白中的各域的实际顺序比对，选出各种比对情况中全局比对得分最高值为模板的最终得分；最后，根据最终得分对进行排名，选择最终得分最高的模板为最终模板。本发明可以较快得到最佳模板，且可以获取域之间方向信息，模板质量较高。
