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[00055171]基于随机森林预测α跨膜蛋白的螺旋相互作用关系的方法
联系人： 中国科学院深圳先进技术研究院
所在地：广东 深圳市
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技术详细介绍
本发明适用于生物计算领域，提供了一种基于随机森林预测α跨膜蛋白的螺旋相互作用关系的方法。该方法包括下述步骤：收集具有确定三维结构的α跨膜蛋白链构建训练集；基于所述的训练集，分别提取所述α跨膜蛋白链中螺旋上相互作用的残基对和非相互作用的残基对特征信息，使用随机森林算法构建预测模型；收集用于测试的、具有确定一级结构的目标α跨膜蛋白，提取其α螺旋中的残基对特征信息，基于所述预测模型进行预测；根据预测结果判断所述目标α跨膜蛋白中的螺旋对是否存在相互作用的残基对。该方法不仅计算速度快，且准确率高。
