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第二代基因测序试剂、技术与装备--扩增子多重PCR技术

项目简介

目前二代测序领域的测序试剂和耗材仍完全依赖进口，国产化迫在眉睫。本项目建立了基于扩增子的高灵敏，高度均一性的多重PCR方案，能够实现针对特定疾病的基因突变的快速测序文库制备，能够以有限肿瘤游离DNA和石蜡包埋样品为原料，实现在纳克级别上的高灵敏度，高重复性和低假阳性的突变检测；解决血液，组织或石蜡包埋等样品缺乏有效的测序文库制备方法，测序步骤繁多、耗时长等关键问题。

技术优势

与现有的赛默飞的Ampliseq技术相比，能够达到w1小时的文库制备时间；可以实现对w2ng起始样品的文库制备；可以检测到W0.1%的突变频率；0.2x平均读长的均一性＞95%。

应用市场

该研究成果适用于测序市场上的Illumina和Ion torrent这两个全球测序产业的龙头平台。主要可以应用在各类癌症，传染病和遗传病在基因水平上的检测。还适用于微生物，病毒以及免疫系统的监测。用户包括科研机构，测序服务型公司和临床医院。

合作模式

技术开发、技术转让

主要研究人员

郑建萍，博士，研究员。硕士生导师，国家海外高层次人才引进计划-青年项目(11批)。2010年博士毕业于美国纽约大学。师从DNA纳米技术创始人Nadrian Seeman教授，在三维DNA纳米自组装方面取得了突出的成就，研究成果发表在自然杂志(Nature)上，是DNA纳米技术发展中的里程碑。2010-2013年在美国国立卫生院NIH从事蛋白药物的博士后研究。2013年在美国加州大学伯克利分校进行DNA载体药物的博士后研究。2013年至2015年在硅谷知名DNA测序公司-MCLAB作为领军研究科学家从事一代和二代基因测序的试剂和方法的开发，包括Illumina样品制备试剂盒 (MCNEXT),快速聚合酶链式反应定量试剂盒及cfDNA提取试剂盒(MCMax)。2015年至2018年在ThermoFisher Scientific任资深科学家，负责二代测序技术Ion torrent平台上的三个NGS肿瘤免疫测序产品：Oncomine TCR Beta-SR Assay, Oncomine Tumor Mutation Load Assay及Oncomine Microsatellite instability Assayo承担宁波市3315计划，企业合作等项目多项。发表文章12篇，研发成功产品7项，授权专利1项。